В соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 15 сентября 2008 года № 1359 «Об открытом акционерном обществе «Оборонсервис», постановлением Правительства Российской Федерации от 22 ноября 2008 года № 875 «О мерах по реализации Указа Президента Российской Федерации от 15 сентября 2008 года № 1359 «Об открытом акционерном обществе «Оборонсервис»», приказом Министра обороны Российской Федерации от 25 мая 2009 года № 468 ФГУП «31 ГПИСС Минобороны России» с 05 августа 2009 года преобразовано в открытое акционерное общество «31 Государственный проектный институт специального строительства».
ОАО «31 ГПИСС» в соответствии с Уставом, утвержденным приказом Министра обороны Российской Федерации от 25 мая 2009 года № 468, является правопреемником ФГУП «31 ГПИСС Минобороны России».
На основании приказа директора департамента имущественных отношений Министерства обороны Российской Федерации от 12 января 2015 года №7 "О решениях внеочередного общего собрания акционеров ОАО "31 ГПИСС" переименовано в Акционерное общество "31 Государственный проектный институт специального строительства" (АО "31 ГПИСС").